{"id":5671,"date":"2021-08-09T00:15:25","date_gmt":"2021-08-08T22:15:25","guid":{"rendered":"http:\/\/variances.eu\/?p=5671"},"modified":"2021-08-09T00:44:26","modified_gmt":"2021-08-08T22:44:26","slug":"le-covid19-les-genes-et-le-comportement","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/variances.eu\/?p=5671","title":{"rendered":"Le Covid19, les g\u00e8nes et le comportement*"},"content":{"rendered":"

La pand\u00e9mie de Covid19 s\u00e9vit maintenant depuis pr\u00e8s d\u2019un an, on peut s\u2019interroger sur les diff\u00e9rences abyssales entre les taux de d\u00e9c\u00e8s d\u2019un pays \u00e0 l\u2019autre. Premier constat, l\u2019Afrique a \u00e9t\u00e9 peu touch\u00e9e. La premi\u00e8re id\u00e9e qui vient \u00e0 l’esprit est que l’Afrique a \u00e9t\u00e9 \u00e9pargn\u00e9e en raison m\u00eame de sa d\u00e9mographie\u00a0: continent jeune, elle paye un tribut plus l\u00e9ger \u00e0 un virus qui touche surtout les plus \u00e2g\u00e9s. Les Africains de plus de 70 ans sont peu nombreux. Admettons, mais pour les Asiatiques, l’argument n’est pas convaincant. Les Japonais sont les champions mondiaux de l’esp\u00e9rance de vie et ils n’ont pas connu une forte mortalit\u00e9 associ\u00e9e \u00e0 la Covid19. C’est un archipel, dira-t-on\u00a0! En Chine, o\u00f9 l\u2019esp\u00e9rance de vie a rattrap\u00e9 celle des \u00c9tats-Unis, la population est aussi \u00e9pargn\u00e9e. On objectera que les Chinois vivent sous un r\u00e9gime dictatorial qui a impos\u00e9 des restrictions inimaginables \u00e0 l’Ouest. Peut-on retenir cependant l’argument de la coercition comme une raison majeure ? Des pays comme Ta\u00efwan, Singapour, la Malaisie, la Tha\u00eflande, le Sri Lanka et la Cor\u00e9e du sud n\u2019ont pas des r\u00e9gimes plus dictatoriaux que la Turquie, la Hongrie, la Pologne ou la Russie, ils connaissent peu de victimes bien que les plus de 65 ans repr\u00e9sentent plus de 10 % de la population (contre moins de 2% en Afrique subsaharienne). Comme le remarque Jean-Paul Sardon (2020), la progression avec l’\u00e2ge du taux des d\u00e9c\u00e8s dus \u00e0 la Covid19 est tr\u00e8s similaire \u00e0 la r\u00e9partition des taux de mortalit\u00e9 par \u00e2ge avant la pand\u00e9mie. Cela est vrai sur tous les continents, mais la cons\u00e9quence en est particuli\u00e8rement manifeste dans les pays d\u00e9velopp\u00e9s o\u00f9 la Covid19, \u00e0 l\u2019instar de la grande faucheuse, se montre impitoyable avec les plus de 70 ans[1]<\/a>. Alors, si sa jeunesse a pu prot\u00e9ger l\u2019Afrique, ce ne sont ni la jeunesse ni l’absence totale des libert\u00e9s d\u00e9mocratiques qui rendent compte de la raret\u00e9 des d\u00e9c\u00e8s en Asie, quoique le pouvoir de contraindre ait pu indiscutablement r\u00e9duire les contaminations.<\/p>\n

G\u00e9ographie des taux de d\u00e9c\u00e8s<\/h3>\n

La variance des taux de d\u00e9c\u00e8s n\u2019est pas la m\u00eame selon que l\u2019on prend comme r\u00e9f\u00e9rence telle ou telle r\u00e9gion du monde, qu\u2019on r\u00e9unit dans la m\u00eame analyse plusieurs r\u00e9gions, qu\u2019on d\u00e9coupe les unit\u00e9s spatiales de mani\u00e8re plus ou moins fine. La notion de pays n\u2019est pas forc\u00e9ment la plus l\u00e9gitime, car la taille et l\u2019homog\u00e9n\u00e9it\u00e9 des nations sont variables, mais c\u2019est le lieu de la d\u00e9cision politique et la plus accessible. Une comparaison portant sur la grande majorit\u00e9 des r\u00e9gions du monde, \u00e9cartant de petites nations (moins de 300\u00a0000 habitants), dont beaucoup d\u2019\u00eeles de l\u2019Atlantique et du Pacifique, montre que la mortalit\u00e9 due \u00e0 la Covid19 affecte tr\u00e8s in\u00e9galement les grandes r\u00e9gions du monde : l\u2019Europe et les Am\u00e9riques sont beaucoup plus touch\u00e9es que l\u2019Afrique et surtout l\u2019Asie (carte ci-dessous).<\/p>\n

Une autre carte pr\u00e9sente avec celle-ci une ressemblance frappante. Elle sugg\u00e8re que le tribut relatif pay\u00e9 \u00e0 la Covid19 est l\u2019effet de la diffusion d\u2019une autre \u00ab\u00a0pand\u00e9mie\u00a0\u00bb\u00a0: l\u2019ob\u00e9sit\u00e9[2]<\/a>. Depuis le d\u00e9but de l\u2019\u00e9pid\u00e9mie de Covid19, les cliniciens ont indiqu\u00e9 que l\u2019ob\u00e9sit\u00e9 est une condition aggravante, impliquant notamment un recours fr\u00e9quent \u00e0 l\u2019assistance respiratoire. On pourrait s\u2019en tenir l\u00e0 et soutenir que le malheur pr\u00e9sent des hommes est une pathologie de l\u2019abondance, la sanction de la r\u00e9ussite \u00e9conomique. L\u2019ob\u00e9sit\u00e9 seule rend compte de pr\u00e8s de 40% de la variance des d\u00e9c\u00e8s entre pays. Toutefois on n\u2019explique pas ainsi comment la contamination s\u2019est diffus\u00e9e. On est alors amen\u00e9 \u00e0 envisager une interpr\u00e9tation diff\u00e9rente, mobilisant le r\u00f4le attribu\u00e9 par les immunologistes \u00e0 la prot\u00e9ine de surface du virus (S), sans exclure l\u2019ob\u00e9sit\u00e9.<\/p>\n

\"\"

Source : carte de l\u2019auteur avec Philcarto ; donn\u00e9es Worldometer 20 d\u00e9cembre 2020<\/p><\/div>\n

G\u00e9ographie de l\u2019ob\u00e9sit\u00e9 2019<\/em><\/p>\n

\"\"

Source : Index mundia<\/p><\/div>\n

Il peut y avoir beaucoup de d\u00e9c\u00e8s parce qu\u2019il y a beaucoup de contaminations, ou parce qu\u2019\u00e0 niveau de contamination donn\u00e9, la l\u00e9talit\u00e9 du virus est forte.\u00a0 Cela n\u2019implique pas les m\u00eames processus sociaux ni les m\u00eames r\u00e9ponses de l\u2019organisme[3]<\/a>. Suivant l\u2019interpr\u00e9tation classique propos\u00e9e par l\u2019\u00e9pid\u00e9miologie, le taux de d\u00e9c\u00e8s se compose comme un produit\u00a0: la part des personnes infect\u00e9es et la proportion de d\u00e9c\u00e8s conditionnellement au fait d\u2019\u00eatre infect\u00e9. Le SARS-cov2 s’attaque aux fonctions respiratoires, il utilise pour p\u00e9n\u00e9trer l’organisme l’affinit\u00e9 de la prot\u00e9ine en pointe avec le r\u00e9cepteur de l\u2019enzyme ACE2 qui se trouve \u00e0 la surface de nos cellules notamment pulmonaires[4]<\/a>. Lorsque cet enzyme est abondamment exprim\u00e9, le virus p\u00e9n\u00e8tre ais\u00e9ment l\u2019organisme, et plus de contaminations impliquent plus de d\u00e9c\u00e8s[5]<\/a>. L\u2019observation des enfants et adolescents qui expriment peu l\u2019enzyme ACE2 dans leurs cellules \u00e9pith\u00e9liales semble corroborer ce fait. En s’arr\u00eatant l\u00e0 on ne comprend pas toutefois l\u2019importance relative des d\u00e9c\u00e8s.<\/p>\n

Sch\u00e9matiquement, la production par le foie d\u2019un pr\u00e9curseur de l\u2019angiotensine est convertie par la r\u00e9nine, une enzyme produite dans les reins, en angiotensine-1. Une premi\u00e8re enzyme, ACE1, contenue notamment dans les poumons, transforme cette angiotensine-1 en angiotensine-2, ce qui entra\u00eene la constriction des muscles lisses, provoquant une r\u00e9tention de l’eau et du sel dans les reins et \u00e9levant la pression sanguine art\u00e9rielle. Si l\u2019enzyme ACE2 est le cheval de Troie qui permet l\u2019entr\u00e9e du virus, c\u2019est aussi ce qui r\u00e9gule l\u2019hypertension et emp\u00eache l\u2019inflammation des poumons. Les individus qui ont la forme ACE-II* du g\u00e8ne ont une expression r\u00e9duite de l\u2019ACE1 et corr\u00e9lativement une forte expression de l\u2019ACE2. Du fait du r\u00f4le r\u00e9gulateur de l\u2019enzyme ACE2, leurs poumons sont mieux prot\u00e9g\u00e9s, \u00e0 l\u2019inverse, chez les individus qui ont la forme ACE-DD, il y a une plus faible expression de l\u2019enzyme ACE2 circulant dans le sang et, en cas d\u2019infection, l\u2019angiotensine-2 moins contr\u00f4l\u00e9e s\u2019accumule dans les cellules \u00e9pith\u00e9liales et enflamme les poumons**.
\n____________
\n* Le double II indique que le g\u00e8ne codant pour l\u2019enzyme ACE1 est de la forme double insertion, ce qui se traduit par un niveau faible d\u2019expression de l\u2019enzyme ACE1 circulant (voir Rigat & al. 1990).
\n**ACE1 et ACE2 sont des enzymes, agissant sur nos fonctionnements face \u00e0 l\u2019infection. Tandis que les g\u00e9notypes ACE-II ou ACE-DD sont le code de fabrication des prot\u00e9ines. Ils n\u2019agissent qu\u2019indirectement \u00e0 travers l\u2019actions des prot\u00e9ines qu\u2019ils ont contribu\u00e9 \u00e0 produire. Ce r\u00e9sum\u00e9 s\u2019appuie notamment sur Devaux & al. (2020).<\/div>\n

L\u2019enzyme ACE2 joue successivement des r\u00f4les oppos\u00e9s\u00a0: sa pr\u00e9sence favorise les infections, mais c\u2019est ensuite sa destruction par le virus qui \u00e9l\u00e8ve les taux de l\u00e9talit\u00e9, c\u2019est-\u00e0-dire de transformation des infections en d\u00e9c\u00e8s. On doit affiner l\u2019\u00e9quation r\u00e9sumant le m\u00e9canisme de propagation de la maladie en dissociant<\/p>\n

    \n
  1. un facteur de susceptibilit\u00e9 (incluant l\u2019exposition au virus, et le d\u00e9veloppement d\u2019une forme symptomatique de la Covid19 sachant que l\u2019on a \u00e9t\u00e9 expos\u00e9),<\/li>\n
  2. un facteur de l\u00e9talit\u00e9\u00a0: mourir (ou d\u00e9velopper une forme grave de la maladie)<\/li>\n<\/ol>\n

    Cette d\u00e9composition est similaire \u00e0 celle qui d\u00e9termine le \u00ab\u00a0R0<\/sub>\u00a0\u00bb.<\/p>\n

    L\u2019enzyme ACE2, les groupes sanguins et l\u2019ob\u00e9sit\u00e9<\/h3>\n

    D\u2019o\u00f9 une reformulation. Comment se distribuent les fragilit\u00e9s, la propension \u00e0 l\u2019hypertension\u00a0et \u00e0 l\u2019inflammation ?\u00a0 Il s\u2019agit de d\u00e9s\u00e9quilibres qui ne sont pas transmissibles mais se manifestent par le caract\u00e8re inappropri\u00e9, par exc\u00e8s ou par d\u00e9faut, des r\u00e9ponses adaptatives et sont influenc\u00e9es par des facteurs g\u00e9n\u00e9tiques. Commen\u00e7ons par l\u00e0.<\/p>\n

    Les donn\u00e9es sur la distribution g\u00e9ographique des polymorphismes du g\u00e8ne codant pour l\u2019enzyme ACE1, enzyme s\u0153ur de ACE2 qui nous int\u00e9resse directement, se sont multipli\u00e9es au cours des quinze derni\u00e8res ann\u00e9es. Pour distinguer les effets des concentration de l\u2019enzyme ACE2, j\u2019ai retenu la fr\u00e9quence du g\u00e9notype ACE-II, la mieux document\u00e9e. La distribution du g\u00e9notype ACE-II qui, \u00e0 travers la densit\u00e9 d\u2019expression de ACE2, r\u00e9gule l\u2019hypertension et les ph\u00e9nom\u00e8nes inflammatoires varie beaucoup d’une r\u00e9gion du monde \u00e0 l’autre\u00a0; elle a une parent\u00e9 certaine avec celle des d\u00e9c\u00e8s dus au Covid19[6]<\/a>.<\/p>\n

    \"\"

    Source : compilation de l\u2019auteur sur la base de nombreuses \u00e9tudes.<\/p><\/div>\n

    La l\u00e9talit\u00e9 du coronavirus d\u00e9rive, on l\u2019a dit, de la propension \u00e0 \u00ab\u00a0l\u2019emballement\u00a0\u00bb du syst\u00e8me immunitaire, des surr\u00e9actions et notamment des thromboses, processus complexes influenc\u00e9s par le groupe sanguin. Par rapport au groupe sanguin O, les individus des groupes sanguins A et B ont des risques de thrombose nettement plus \u00e9lev\u00e9s. Ce que soulignent Groot & al. (2020), notant cependant des effets divers des groupes sanguins A et B sur les caract\u00e9ristiques des cellules sanguines. La fr\u00e9quence du groupe O d\u00e9finit un second facteur g\u00e9n\u00e9tique \u00e0 envisager.<\/p>\n

    Les profils g\u00e9n\u00e9tiques comme les habitudes de vie ont une certaine homog\u00e9n\u00e9it\u00e9 au sein de chaque continent. Aussi ai-je distingu\u00e9 de grandes r\u00e9gions qui recoupent les cinq continents. Cependant pour l\u2019Afrique subsaharienne, les travaux consult\u00e9s indiquent que la pr\u00e9valence du g\u00e9notype ACE-II diff\u00e8re sensiblement entre l\u2019Est et l\u2019Ouest, ce qui m\u2019a conduit \u00e0 en faire deux r\u00e9gions. L\u2019Afrique du Nord est rattach\u00e9e au pays du Moyen Orient. Voici la distribution des taux de d\u00e9c\u00e8s, des taux de contamination (mentionn\u00e9s \u00e0 titre indicatif) et des valeurs des param\u00e8tres g\u00e9n\u00e9tiques dans les grandes r\u00e9gions distingu\u00e9es.<\/p>\n

    \"\"

    Sources\u00a0: Worldometer au 15 d\u00e9cembre 2020, Wikipedia, publications des Nations Unies et nombreuses monographies et m\u00e9ta-analyses des polymorphismes g\u00e9n\u00e9tiques.<\/p><\/div>\n

    Ces facteurs g\u00e9n\u00e9tiques, ou g\u00e9n\u00e9tiquement influenc\u00e9s, s\u2019imposent quels que soient les comportements des individus, les syst\u00e8mes de sant\u00e9 et les politiques publiques en ce domaine. Ils n\u2019\u00e9puisent pas l\u2019explication, cependant il nous para\u00eet coh\u00e9rent avec l\u2019argument d\u00e9velopp\u00e9 plus haut de commencer par l\u00e0. Dans chaque pays, i, le nombre de d\u00e9c\u00e8s dus \u00e0 l’\u00e9pid\u00e9mie au moment t peut \u00eatre d\u00e9fini par la relation suivante\u00a0:<\/p>\n

    \"<\/p>\n

    Sachant que le temps moyen qui s\u00e9pare l\u2019infection du d\u00e9c\u00e8s \u00e9ventuel est de 22 jours, il faut introduire un d\u00e9calage temporel. Le taux de d\u00e9c\u00e8s dans un pays est le produit des infections cumul\u00e9es sur la p\u00e9riode consid\u00e9r\u00e9e (d\u00e9cal\u00e9es de trois semaines) et du taux de l\u00e9talit\u00e9 \"\u00a0(case fatality rate), <\/em>qui est en principe stable \u00e0 court terme. L’exc\u00e8s de d\u00e9c\u00e8s peut encore s’\u00e9crire :<\/p>\n

    \"ln<\/p>\n

    Cette expression traduit le fait que le log naturel du nombre cumul\u00e9 de d\u00e9c\u00e8s est la somme de deux composantes\u00a0: le cumul des infections avec un d\u00e9calage appropri\u00e9 et la gravit\u00e9 de ces atteintes. On peut de plus consid\u00e9rer l\u2019infection et la l\u00e9talit\u00e9 dans chaque pays comme le produit d\u2019un facteur r\u00e9gional indic\u00e9 par j, <\/em>et d\u2019une composante nationale indic\u00e9e par i, d\u2019o\u00f9 en passant au log[7]<\/a>\u00a0:<\/p>\n

    \"ln<\/p>\n

    Les \u00a0composants des \u00e9carts nationaux au taux r\u00e9gional de d\u00e9c\u00e8s, \"\\varepsilon et \"\\varepsilon, traduisent des effets sur la l\u00e9talit\u00e9 et sur les infections dont ne rendent pas compte les facteurs g\u00e9n\u00e9tiques utilis\u00e9s. Ainsi, s\u2019ils sont positifs, le surcro\u00eet de densit\u00e9 des contacts, les fragilit\u00e9s pathologiques nationales, la structure d\u2019\u00e2ge de la population du pays ou les limites des politiques men\u00e9es (confinement, diffusion des masques).<\/p>\n

    Pour mettre \u00e0 l\u2019\u00e9preuve cette interpr\u00e9tation, ont \u00e9t\u00e9 utilis\u00e9s des mod\u00e8les hi\u00e9rarchiques distinguant deux niveaux\u00a0: les grandes r\u00e9gions du monde et, au sein des r\u00e9gions, les pays (sans recourir aux taux d\u2019infection).<\/p>\n

    \"\"

    Note: .01 – ***; .05 – **; .1 – *. Du fait des valeurs manquantes concernant les polymorphismes,
    et les groupes sanguins, le nombre des pays effectivement utilis\u00e9s est inf\u00e9rieur \u00e0 177 (nb de
    pays o\u00f9 l\u2019on dispose des taux de d\u00e9c\u00e8s).<\/p><\/div>\n

    Les constantes r\u00e9gionales sont des effets al\u00e9atoires estim\u00e9s dont les valeurs d\u00e9pendent des param\u00e8tres g\u00e9n\u00e9tiques pris en compte. Ainsi pour l\u2019\u00e9quation 2, les estimations des Uj sont :<\/p>\n

    \"\"<\/p>\n

    Pour l\u2019Asie Caucase, le taux de d\u00e9c\u00e8s par million est exp(7,26+0,393) \/exp(4,54)<\/em>, tandis que pour l\u2019Europe occidentale & Am\u00e9rique du nord,\u00a0le taux estim\u00e9 est\u00a0 exp(7,26+1,836)\/exp(2,95)<\/em>. Le facteur d\u2019att\u00e9nuation, au d\u00e9nominateur, dont la valeur d\u00e9pend des param\u00e8tres g\u00e9n\u00e9tiques, est beaucoup plus favorable \u00e0 l\u2019Asie.<\/p>\n

    Une fr\u00e9quence \u00e9lev\u00e9e du g\u00e9notype ACE-II r\u00e9duit le taux des d\u00e9c\u00e8s (coefficients n\u00e9gatifs)[8]<\/a>. En d\u2019autres termes, les populations porteuses de ce g\u00e9notype \u2013 essentiellement asiatiques \u2013 sont moins vuln\u00e9rables que les Occidentaux et surtout que les Africains chez lesquels il est rare.<\/p>\n

    De m\u00eame, l\u00e0 o\u00f9 elle est forte, la pr\u00e9valence du groupe sanguin O+ diminue significativement le risque de mortalit\u00e9.\u00a0 En Am\u00e9rique Latine et dans une moindre mesure en Afrique, elle prot\u00e8ge\u00a0; sa raret\u00e9 en Europe et en Asie contribue \u00e0 y augmenter la vuln\u00e9rabilit\u00e9 des populations.<\/p>\n

    En revanche, une forte pr\u00e9valence de l\u2019ob\u00e9sit\u00e9, ou des g\u00e8nes associ\u00e9s, tend \u00e0 \u00e9lever la mortalit\u00e9. Les r\u00e9gions o\u00f9 ce taux d\u2019ob\u00e9sit\u00e9 est encore faible \u2013 Asie et Afrique \u2013 sont par-l\u00e0 prot\u00e9g\u00e9es, \u00e0 l\u2019inverse, au Moyen-Orient, l\u2019ob\u00e9sit\u00e9 pourrait contribuer \u00e0 \u00e9lever le tribut du Covid19[9]<\/a>.<\/p>\n

    Modulations nationales<\/h3>\n

    La combinaison de ces facteurs g\u00e9n\u00e9tiques, ou influenc\u00e9s g\u00e9n\u00e9tiquement, rend compte d\u2019une partie des diff\u00e9rences de mortalit\u00e9 d\u2019un pays \u00e0 l\u2019autre. Il s\u2019agit surtout des variations de la l\u00e9talit\u00e9, reste \u00e0 rendre compte des diff\u00e9rences plut\u00f4t associ\u00e9es aux processus d\u2019infection, sur lesquels s\u2019appliquent les taux de l\u00e9talit\u00e9.<\/p>\n

    C\u2019est cette partie inexpliqu\u00e9e par les facteurs g\u00e9n\u00e9tiques pris en compte, que l\u2019on consid\u00e8re maintenant. La variable d\u00e9pendante utilis\u00e9e ici ce sont les \u2018r\u00e9sidus\u2019 des taux de d\u00e9c\u00e8s une fois d\u00e9falqu\u00e9e la part expliqu\u00e9e par les facteurs g\u00e9n\u00e9tiques dans le mod\u00e8le hi\u00e9rarchique[10]<\/a>. Les taux cumul\u00e9s d\u2019infection sont, au sein des grandes r\u00e9gions du monde,\u00a0caract\u00e9ris\u00e9s par des similitudes de contexte climatique et de densit\u00e9 des contacts entre les individus. Ils sont modul\u00e9s d\u2019un pays \u00e0 l\u2019autre par des diff\u00e9rences sociales et comportementales et par des fragilit\u00e9s physiques ind\u00e9pendantes des facteurs g\u00e9n\u00e9tiques pris en compte. On a estim\u00e9 deux \u00e9quations selon que l\u2019ob\u00e9sit\u00e9 a \u00e9t\u00e9 utilis\u00e9e comme proxy-g\u00e9n\u00e9tique ou ne l\u2019a pas \u00e9t\u00e9.<\/p>\n

    \"\"

    Note : le nombre de pays est r\u00e9duit du fait des valeurs manquantes pour la taille des m\u00e9nages.<\/p><\/div>\n

    Lorsqu\u2019on ne la prend pas comme proxy<\/em> g\u00e9n\u00e9tique, l\u2019ob\u00e9sit\u00e9-pathologie \u00e9l\u00e8ve significativement les taux de d\u00e9c\u00e8s (eq4). Les pays comme la France ou l\u2019Italie sont cette fois favoris\u00e9s (la proportion d\u2019ob\u00e8ses y est faible), par rapport \u00e0 l\u2019Irlande ou \u00e0 la Gr\u00e8ce o\u00f9 les personnes en surpoids sont nombreuses. Outre l\u2019ob\u00e9sit\u00e9 qui, \u00e0 dispositions g\u00e9n\u00e9tiques \u00e9gales, accroit le taux des d\u00e9c\u00e8s, deux autres variables sont importantes\u00a0: la structure d\u2019\u00e2ge et la taille des unit\u00e9s domestiques. Un pourcentage \u00e9lev\u00e9 de familles de six personnes ou plus tend \u00e0 augmenter le tribut pay\u00e9 au Covid19 en \u00e9levant les infections.<\/p>\n

    Ainsi, au 15 d\u00e9cembre 2020, pour un taux de mortalit\u00e9 europ\u00e9en autour de 700 par million (le taux europ\u00e9en des d\u00e9c\u00e8s une fois contr\u00f4l\u00e9\u00a0les facteurs g\u00e9n\u00e9tiques), la France et l\u2019Italie d\u2019un c\u00f4t\u00e9 avec 1000 d\u00e9c\u00e8s par million sont \u00e0 -300 (700 -1000), l\u2019Allemagne et le Danemark de l\u2019autre avec 400 d\u00e9c\u00e8s par million sont \u00e0 +300 (700 \u2013 400). Les coefficients s\u2019interpr\u00e8tent alors ais\u00e9ment\u00a0: l\u2019Italie et la France ont plus de familles larges, un coefficient n\u00e9gatif appliqu\u00e9 \u00e0 ce surcroit rend compte du -300, et ce m\u00eame coefficient n\u00e9gatif appliqu\u00e9 au \u2018d\u00e9ficit\u2019 de grands m\u00e9nages des Allemands et Danois rend compte du +300 (voir graphique ci-dessous).<\/p>\n

    \"\"R\u00e9ciproquement la France a, r\u00e9gionalement \u2018parlant\u2019, une population l\u00e9g\u00e8rement plus jeune, un \u2018faible\u2019 taux de plus de 65 ans, qui r\u00e9duit son taux de d\u00e9c\u00e8s (car s\u2019agissant des infections, le d\u00e9ficit de personnes \u00e2g\u00e9es, c\u2019est moins de contacts).<\/p>\n

    Cette analyse, dissociant le r\u00f4le des facteurs qui r\u00e9gissent la l\u00e9talit\u00e9 de celui des facteurs favorisant les contaminations, s\u2019articule sur l\u2019explication biom\u00e9dicale. Les taux de l\u00e9talit\u00e9 sont en quelque sorte des \u00ab\u00a0coefficients de transformation\u00a0\u00bb en d\u00e9c\u00e8s des stocks de contaminations sp\u00e9cifiques aux grandes r\u00e9gions du monde. Ainsi la \u2018faible\u2019 mortalit\u00e9 en Asie en 2020 s\u2019expliquerait largement par les dispositions g\u00e9n\u00e9tiques pr\u00e9valentes, notamment la fr\u00e9quence du g\u00e9notype ACE-II, qui permettent de mieux r\u00e9sister aux d\u00e9r\u00e8glements hypertensifs et \u00e0 l\u2019emballement inflammatoire. Par ailleurs l\u2019analyse sugg\u00e8re que les diff\u00e9rences de taux contamination, sur lesquelles s\u2019appliquent les taux de l\u00e9talit\u00e9, d\u00e9pendent notamment de la taille des m\u00e9nages, de la part des personnes \u00e2g\u00e9es et encore de l\u2019ob\u00e9sit\u00e9, qui favorise une expression accrue du r\u00e9cepteur ACE2 dans les tissus adipeux.<\/p>\n

    *<\/p>\n

    Naturellement cette analyse reste extr\u00eamement sch\u00e9matique et parle du pass\u00e9, elle porte sur la souche du Covid19 avant que l\u2019effet des mutations r\u00e9centes ne soit sensible. Les nouvelles souches \u00e9tant, \u00e0 densit\u00e9 de contacts \u00e9gale, plus contagieuses, il y a une nouvelle combinaison entre le pouvoir d\u2019infection biologique du virus et la densit\u00e9 des contacts.<\/p>\n

    Si cette analyse a une port\u00e9e politique, c\u2019est de souligner la fragilit\u00e9 des pays occidentaux, la menace qui p\u00e8se sur l\u2019Afrique \u00e0 cause des dispositions immunitaires et d\u2019un syst\u00e8me de sant\u00e9 plus pr\u00e9caire, ce qui nous oblige en termes d\u2019acc\u00e8s aux vaccins et d\u2019antiviraux.<\/p>\n

     <\/p>\n

    Mots-cl\u00e9s : Covid19 – enzyme ACE2 – ob\u00e9sit\u00e9 – d\u00e9mographie<\/em><\/p>\n

    Cet article a \u00e9t\u00e9 initialement publi\u00e9 le 1er f\u00e9vrier 2021.<\/em><\/p>\n

     <\/p>\n

    * L\u2019auteur remercie G\u00e9rard Bouvier, A Minczeles et Eric Taz\u00e9-Bernard pour leurs remarques sur ce texte.<\/em><\/p>\n

    \n

    R\u00e9f\u00e9rences<\/h3>\n

    Delanghe J., Speeckaert M., De Buyzere M. (2020) ACE polymorphism and COVID-19 outcome.\u00a0 Endocrine<\/em> 70:13\u201314.https:\/\/doi.org\/10.1007\/s12020-020-02454-7<\/p>\n

    Devaux\u00a0 Ch., Rolain J-M., Raoult D. (2020) ACE2 receptor polymorphism: Susceptibility to SARS-CoV-2, hypertension, multi-organ failure. Science Direct<\/em>, May.<\/p>\n

    Groot D. & al. (2020) Arteriosclerosis, Thrombosis, and Vascular constriction. Biology<\/em> 40: https:\/\/doi.org\/10.1161\/ATVBAHA.119.313658<\/a><\/span><\/span>.<\/p>\n

    Rigat B., Hubert Ch., Alhenc-Gelas\u00a0 F.,\u00a0 Cambien F., Corvol P., Soubrie F. (1990) An Insertion\/Deletion Polymorphism in the Angiotensin I-converting Enzyme Gene Accounting for Half the Variance of Serum Enzyme Levels. J. Clin. Invest<\/em>. Vol. 86, October, 1343-1346<\/p>\n

    Sardon J.-P. (2020) De la longue histoire des \u00e9pid\u00e9mies au Covid-19, Les analyses de Population & Avenir<\/em>, avril, 1-30.<\/p>\n

    \"\"

    *<\/p><\/div>\n

    \n

    [1]<\/a> Mais s\u2019av\u00e8re assez impitoyable apr\u00e8s. En effet pour les Occidentaux, l\u2019\u00e9largissement de l’esp\u00e9rance de vie n\u2019est pas d\u00fb \u00e0 la r\u00e9duction de la mortalit\u00e9 infantile mais au maintien en vie d’hommes et de femmes fragilis\u00e9s certes mais qu’un confort mat\u00e9riel et une m\u00e9decine moderne prot\u00e8gent \u00e0 court terme.<\/p>\n

    [2]<\/a> L\u2019ob\u00e9sit\u00e9 est un m\u00e9lange de maladie souffrance et de \u00ab\u00a0maladie\u00a0\u00bb comportement. L\u2019ob\u00e9sit\u00e9 n\u2019est pas communicable au sens m\u00e9dical \u2013 l\u2019emploi du mot \u00e9pid\u00e9mie pour la diffusion de l\u2019ob\u00e9sit\u00e9 ne peut \u00eatre que m\u00e9taphorique.<\/p>\n

    [3]<\/a> Ni les m\u00eames enjeux en termes de politique de sant\u00e9.<\/p>\n

    [4]<\/a> Selon l\u2019acronyme anglais.<\/p>\n

    [5]<\/a> Cette voie a \u00e9t\u00e9 emprunt\u00e9e par Delanghe et al. 2020, pour l\u2019Europe, sans dissocier toutefois infection et l\u00e9talit\u00e9.<\/p>\n

    [6]<\/a> On pourrait, si l\u2019information \u00e9tait ais\u00e9ment accessible, prendre en compte d\u2019autres polymorphismes, notamment ceux qui affectent l\u2019expression de la prot\u00e9ase trans-membrane TMPRSS2, qui contribue \u00e0 l\u2019accrochage du virus sur les cellules pulmonaires. Comme l\u2019expression de TMPRSS2 est \u00e9troitement corr\u00e9l\u00e9e \u00e0 celle d\u2019ACE2, elle figure implicitement dans ce mod\u00e8le.<\/p>\n

    [7]<\/a> Les valeurs des taux nationaux d\u2019infection \" peuvent s\u2019\u00e9crire multiplicativement : \" ou additivement : \" . Les quantit\u00e9s \"ln sont sp\u00e9cifiques \u00e0 chacune de ces grandes r\u00e9gions (l\u2019indice \"j\" ne prend que six valeurs).\u00a0 De m\u00eame pour la l\u00e9talit\u00e9 \"CFR \u00a0soit en log : \"ln(CFR.\u00a0 Et l\u2019on peut regrouper \"\\varepsilon'^{i}\" et \"\\varepsilon^{i}\"\u00a0<\/sup>en un r\u00e9sidu unique \"\\gamma^{i}\".<\/p>\n

    [8]<\/a> On l\u2019a v\u00e9rifi\u00e9 dans chaque r\u00e9gion prise s\u00e9par\u00e9ment.<\/p>\n

    [9]<\/a> Mais il faut \u00eatre prudent car on raisonne ici sur l\u2019ob\u00e9sit\u00e9 comme si c\u2019\u00e9tait la mesure d\u2019une disposition g\u00e9n\u00e9tique.<\/p>\n

    [10]<\/a> C\u2019est-\u00e0-dire la valeur moyenne r\u00e9gionale du taux de d\u00e9c\u00e8s une fois d\u00e9falqu\u00e9e la part des facteurs g\u00e9n\u00e9tiques.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

    La pand\u00e9mie de Covid19 s\u00e9vit maintenant depuis pr\u00e8s d\u2019un an, on peut s\u2019interroger sur les diff\u00e9rences abyssales entre les taux de d\u00e9c\u00e8s d\u2019un pays \u00e0 l\u2019autre. Premier constat, l\u2019Afrique a \u00e9t\u00e9 peu touch\u00e9e. La premi\u00e8re id\u00e9e qui vient \u00e0 l’esprit est que l’Afrique a \u00e9t\u00e9 \u00e9pargn\u00e9e en raison m\u00eame de sa d\u00e9mographie\u00a0: continent jeune, elle […]<\/p>\n","protected":false},"author":259,"featured_media":5704,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_et_pb_use_builder":"","_et_pb_old_content":"","_et_gb_content_width":"","_exactmetrics_skip_tracking":false,"_exactmetrics_sitenote_active":false,"_exactmetrics_sitenote_note":"","_exactmetrics_sitenote_category":0,"footnotes":""},"categories":[214],"tags":[],"class_list":["post-5671","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-coronavirus","et-has-post-format-content","et_post_format-et-post-format-standard"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/variances.eu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/5671","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/variances.eu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/variances.eu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/variances.eu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/259"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/variances.eu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=5671"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/variances.eu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/5671\/revisions"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/variances.eu\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/media\/5704"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/variances.eu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=5671"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/variances.eu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcategories&post=5671"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/variances.eu\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Ftags&post=5671"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}